DNA甲基化是重要的表观遗传学标记信息，获得全基因组范围内所有C位点的甲基化水平数据，对于表观遗传学的时空特异性研究具有重要意义。我们以新一代高通量测序平台为基础，进行低成本、高效率、高准确度的全基因组DNA甲基化水平图谱绘制。特定物种的高精确度甲基化修饰模式的分析，必将在表观基因组学研究中具有里程碑式的意义，并为细胞分化、组织发育等基础机制研究，以及动植物育种、人类健康与疾病研究奠定基础。

技术路线

生物信息服务

样品要求

1) 样品总量：≥ 10ug;

2) 样品浓度：≥ 50ng/ul。

3) 样品纯度：OD值260/280应在1.8～2.0;

4) 样品质量：基因组完整、无降解、无污染。

5) 样品包装：用封口膜密封样品，DNA低温运输（-20℃）。

应用案例

对两只家蚕（Bombyx mori）丝腺组织进行了研究，发现非CpG位点（CHG和CHH）的假阳性率非常高。结合两个个体的mCs位点，构建了家蚕全基因组甲基化图谱。共发现173,505个mC，其中99.2%发生在CG位点。基因区的绝对/相对甲基化率明显较高，而与smRNA互补的基因序列的甲基化程度也高于全基因组甲基化的平均水平。基因的表达水平与甲基化水平有显著正相关，但启动子区的甲基化水平则与基因表达水平无相关性。该研究为低甲基化物种的研究开创了一个新的格局，证实Bisulfite-Seq可用于此类物种的研究。

参考文献：

[1] Xiang H, Zhu J, Chen Q, et al. Single base-resolution methylome of the silkworm reveals a sparse epigenomic map. Nat Biotechnol 2010;28:516-20.

[2] Lister R, Pelizzola M, Dowen RH, et al. Human DNA methylomes at base resolution show widespread epigenomic differences.Nature, 2009, 462:315-322.

[3]Feng S, Cokus SJ, Zhang X, et al.Conservation and divergence of methylation patterning in plants and animals.Proc Natl Acad Sci., 2010, 107:8689–8694.